Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC173Q0VFZ6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms