Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A11Q08AI6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms