Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLFN5Q08AF3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLFN5Q08AF3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLFN5Q08AF3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.6 ms