Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CD47Q08722 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CD47Q08722 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CD47Q08722 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CD47Q08722 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CD47Q08722 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CD47Q08722 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CD47Q08722 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CD47Q08722 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CD47Q08722 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CD47Q08722 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CD47Q08722 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CD47Q08722 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CD47Q08722 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CD47Q08722 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CD47Q08722 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CD47Q08722 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CD47Q08722 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CD47Q08722 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CD47Q08722 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CD47Q08722 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CD47Q08722 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CD47Q08722 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CD47Q08722 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CD47Q08722 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CD47Q08722 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CD47Q08722 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD47Q08722 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD47Q08722 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD47Q08722 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD47Q08722 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD47Q08722 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD47Q08722 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD47Q08722 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD47Q08722 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD47Q08722 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD47Q08722 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD47Q08722 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD47Q08722 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CD47Q08722 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD47Q08722 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD47Q08722 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD47Q08722 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD47Q08722 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD47Q08722 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD47Q08722 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD47Q08722 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD47Q08722 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD47Q08722 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CD47Q08722 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD47Q08722 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CD47Q08722 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD47Q08722 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD47Q08722 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD47Q08722 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD47Q08722 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD47Q08722 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD47Q08722 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD47Q08722 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD47Q08722 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD47Q08722 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD47Q08722 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CD47Q08722 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD47Q08722 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD47Q08722 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD47Q08722 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD47Q08722 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD47Q08722 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CD47Q08722 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CD47Q08722 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CD47Q08722 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD47Q08722 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD47Q08722 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD47Q08722 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD47Q08722 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD47Q08722 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD47Q08722 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD47Q08722 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD47Q08722 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD47Q08722 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CD47Q08722 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD47Q08722 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD47Q08722 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD47Q08722 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD47Q08722 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD47Q08722 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD47Q08722 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD47Q08722 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD47Q08722 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD47Q08722 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD47Q08722 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CD47Q08722 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD47Q08722 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD47Q08722 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD47Q08722 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD47Q08722 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD47Q08722 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD47Q08722 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD47Q08722 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD47Q08722 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms