Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP1Q04837 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSBP1Q04837 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms