Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFHR1Q03591 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFHR1Q03591 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms