Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
ERCC6Q03468 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC38.99■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC38.99■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC38.96■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC38.95■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
ERCC6Q03468 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC38.93■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
ERCC6Q03468 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC38.88■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC38.86■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC38.86■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
ERCC6Q03468 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms