Protein–RNA interactions for Protein: Q03403

TFF2, Trefoil factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF2Q03403 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFF2Q03403 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFF2Q03403 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFF2Q03403 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFF2Q03403 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFF2Q03403 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFF2Q03403 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFF2Q03403 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFF2Q03403 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFF2Q03403 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFF2Q03403 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFF2Q03403 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFF2Q03403 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms