Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NHLH2Q02577 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLH2Q02577 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms