Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SP4Q02446 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SP4Q02446 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SP4Q02446 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SP4Q02446 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SP4Q02446 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SP4Q02446 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SP4Q02446 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SP4Q02446 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SP4Q02446 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SP4Q02446 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SP4Q02446 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SP4Q02446 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SP4Q02446 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SP4Q02446 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SP4Q02446 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SP4Q02446 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SP4Q02446 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SP4Q02446 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SP4Q02446 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SP4Q02446 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SP4Q02446 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SP4Q02446 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SP4Q02446 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SP4Q02446 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SP4Q02446 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SP4Q02446 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SP4Q02446 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SP4Q02446 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SP4Q02446 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SP4Q02446 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SP4Q02446 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SP4Q02446 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SP4Q02446 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SP4Q02446 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SP4Q02446 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SP4Q02446 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SP4Q02446 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SP4Q02446 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SP4Q02446 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SP4Q02446 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SP4Q02446 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SP4Q02446 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SP4Q02446 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SP4Q02446 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SP4Q02446 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SP4Q02446 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SP4Q02446 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SP4Q02446 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SP4Q02446 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SP4Q02446 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SP4Q02446 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SP4Q02446 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SP4Q02446 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SP4Q02446 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SP4Q02446 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SP4Q02446 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SP4Q02446 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SP4Q02446 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SP4Q02446 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SP4Q02446 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SP4Q02446 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SP4Q02446 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SP4Q02446 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SP4Q02446 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SP4Q02446 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SP4Q02446 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SP4Q02446 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SP4Q02446 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SP4Q02446 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SP4Q02446 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SP4Q02446 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SP4Q02446 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SP4Q02446 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SP4Q02446 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SP4Q02446 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SP4Q02446 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SP4Q02446 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SP4Q02446 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SP4Q02446 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP4Q02446 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP4Q02446 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP4Q02446 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP4Q02446 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP4Q02446 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP4Q02446 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP4Q02446 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP4Q02446 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP4Q02446 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP4Q02446 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP4Q02446 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SP4Q02446 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP4Q02446 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SP4Q02446 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SP4Q02446 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SP4Q02446 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SP4Q02446 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SP4Q02446 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SP4Q02446 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SP4Q02446 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms