Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSG1Q02413 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DSG1Q02413 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 387.5 ms