Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC6A3Q01959 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A3Q01959 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms