Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAP1Q01518 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAP1Q01518 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAP1Q01518 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAP1Q01518 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAP1Q01518 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAP1Q01518 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAP1Q01518 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAP1Q01518 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAP1Q01518 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAP1Q01518 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAP1Q01518 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAP1Q01518 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAP1Q01518 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAP1Q01518 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAP1Q01518 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAP1Q01518 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAP1Q01518 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAP1Q01518 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAP1Q01518 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAP1Q01518 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAP1Q01518 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAP1Q01518 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAP1Q01518 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAP1Q01518 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CAP1Q01518 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAP1Q01518 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAP1Q01518 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAP1Q01518 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAP1Q01518 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAP1Q01518 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAP1Q01518 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAP1Q01518 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAP1Q01518 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAP1Q01518 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAP1Q01518 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAP1Q01518 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAP1Q01518 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAP1Q01518 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAP1Q01518 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAP1Q01518 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAP1Q01518 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAP1Q01518 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAP1Q01518 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAP1Q01518 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAP1Q01518 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAP1Q01518 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAP1Q01518 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAP1Q01518 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms