Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2F1Q01094 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F1Q01094 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 289.7 ms