Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MDM2Q00987 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms