Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPS9P82933 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPS9P82933 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPS9P82933 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPS9P82933 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPS9P82933 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPS9P82933 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPS9P82933 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPS9P82933 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPS9P82933 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPS9P82933 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPS9P82933 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPS9P82933 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPS9P82933 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPS9P82933 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPS9P82933 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPS9P82933 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPS9P82933 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPS9P82933 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPS9P82933 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPS9P82933 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPS9P82933 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPS9P82933 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPS9P82933 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms