Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ASIC1P78348 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASIC1P78348 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASIC1P78348 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms