Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HBBP68871 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HBBP68871 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HBBP68871 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HBBP68871 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HBBP68871 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HBBP68871 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HBBP68871 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HBBP68871 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HBBP68871 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HBBP68871 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HBBP68871 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HBBP68871 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HBBP68871 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HBBP68871 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HBBP68871 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HBBP68871 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HBBP68871 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HBBP68871 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HBBP68871 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HBBP68871 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HBBP68871 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HBBP68871 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HBBP68871 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HBBP68871 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HBBP68871 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HBBP68871 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HBBP68871 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HBBP68871 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HBBP68871 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HBBP68871 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HBBP68871 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HBBP68871 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HBBP68871 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HBBP68871 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HBBP68871 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HBBP68871 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HBBP68871 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HBBP68871 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HBBP68871 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HBBP68871 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HBBP68871 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HBBP68871 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HBBP68871 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HBBP68871 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HBBP68871 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HBBP68871 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HBBP68871 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HBBP68871 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HBBP68871 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HBBP68871 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HBBP68871 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HBBP68871 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HBBP68871 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HBBP68871 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HBBP68871 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HBBP68871 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HBBP68871 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HBBP68871 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HBBP68871 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HBBP68871 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HBBP68871 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HBBP68871 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HBBP68871 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HBBP68871 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HBBP68871 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HBBP68871 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HBBP68871 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HBBP68871 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HBBP68871 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HBBP68871 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HBBP68871 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HBBP68871 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HBBP68871 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HBBP68871 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HBBP68871 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HBBP68871 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HBBP68871 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HBBP68871 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HBBP68871 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HBBP68871 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HBBP68871 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HBBP68871 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HBBP68871 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HBBP68871 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HBBP68871 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HBBP68871 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HBBP68871 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HBBP68871 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HBBP68871 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HBBP68871 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HBBP68871 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HBBP68871 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HBBP68871 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HBBP68871 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HBBP68871 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HBBP68871 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HBBP68871 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HBBP68871 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HBBP68871 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms