Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P62891 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P62891 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P62891 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P62891 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P62891 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P62891 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P62891 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P62891 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P62891 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P62891 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P62891 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P62891 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P62891 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P62891 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P62891 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P62891 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P62891 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P62891 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P62891 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P62891 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P62891 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P62891 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P62891 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P62891 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P62891 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P62891 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P62891 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P62891 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P62891 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P62891 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P62891 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P62891 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P62891 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P62891 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P62891 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P62891 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P62891 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P62891 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P62891 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P62891 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P62891 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P62891 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P62891 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P62891 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P62891 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P62891 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P62891 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P62891 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P62891 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P62891 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P62891 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P62891 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P62891 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P62891 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P62891 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P62891 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P62891 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P62891 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P62891 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P62891 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P62891 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P62891 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P62891 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P62891 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P62891 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P62891 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P62891 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P62891 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P62891 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P62891 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P62891 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P62891 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P62891 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P62891 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P62891 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P62891 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P62891 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P62891 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P62891 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P62891 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P62891 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P62891 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P62891 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P62891 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P62891 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL39P62891 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL39P62891 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL39P62891 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL39P62891 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL39P62891 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P62891 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P62891 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P62891 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P62891 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P62891 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P62891 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P62891 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P62891 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL39P62891 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms