Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VBP1P61758 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VBP1P61758 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VBP1P61758 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VBP1P61758 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VBP1P61758 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VBP1P61758 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VBP1P61758 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VBP1P61758 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VBP1P61758 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VBP1P61758 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VBP1P61758 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VBP1P61758 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VBP1P61758 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VBP1P61758 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VBP1P61758 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VBP1P61758 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VBP1P61758 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VBP1P61758 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VBP1P61758 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VBP1P61758 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VBP1P61758 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VBP1P61758 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VBP1P61758 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VBP1P61758 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VBP1P61758 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VBP1P61758 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VBP1P61758 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VBP1P61758 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VBP1P61758 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VBP1P61758 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VBP1P61758 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VBP1P61758 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VBP1P61758 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VBP1P61758 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VBP1P61758 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VBP1P61758 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VBP1P61758 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VBP1P61758 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VBP1P61758 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VBP1P61758 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VBP1P61758 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VBP1P61758 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VBP1P61758 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VBP1P61758 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VBP1P61758 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VBP1P61758 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VBP1P61758 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VBP1P61758 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VBP1P61758 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VBP1P61758 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VBP1P61758 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VBP1P61758 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VBP1P61758 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VBP1P61758 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VBP1P61758 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VBP1P61758 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
VBP1P61758 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VBP1P61758 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VBP1P61758 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VBP1P61758 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VBP1P61758 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VBP1P61758 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VBP1P61758 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VBP1P61758 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VBP1P61758 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VBP1P61758 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VBP1P61758 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VBP1P61758 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VBP1P61758 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VBP1P61758 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VBP1P61758 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VBP1P61758 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VBP1P61758 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VBP1P61758 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VBP1P61758 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VBP1P61758 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
VBP1P61758 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VBP1P61758 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VBP1P61758 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VBP1P61758 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VBP1P61758 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VBP1P61758 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VBP1P61758 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VBP1P61758 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VBP1P61758 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VBP1P61758 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VBP1P61758 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VBP1P61758 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VBP1P61758 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VBP1P61758 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VBP1P61758 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VBP1P61758 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VBP1P61758 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VBP1P61758 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VBP1P61758 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VBP1P61758 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VBP1P61758 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VBP1P61758 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
VBP1P61758 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms