Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVFC1P60507 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ERVFC1P60507 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVFC1P60507 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms