Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSCP56915 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSCP56915 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSCP56915 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSCP56915 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSCP56915 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSCP56915 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSCP56915 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSCP56915 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSCP56915 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSCP56915 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSCP56915 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSCP56915 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSCP56915 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSCP56915 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSCP56915 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSCP56915 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSCP56915 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSCP56915 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSCP56915 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSCP56915 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSCP56915 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSCP56915 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSCP56915 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSCP56915 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSCP56915 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSCP56915 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSCP56915 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSCP56915 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSCP56915 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSCP56915 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSCP56915 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSCP56915 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSCP56915 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSCP56915 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSCP56915 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSCP56915 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSCP56915 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSCP56915 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSCP56915 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GSCP56915 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GSCP56915 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSCP56915 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSCP56915 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSCP56915 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSCP56915 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSCP56915 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSCP56915 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSCP56915 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSCP56915 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GSCP56915 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GSCP56915 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSCP56915 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSCP56915 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSCP56915 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GSCP56915 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSCP56915 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSCP56915 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSCP56915 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSCP56915 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSCP56915 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSCP56915 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSCP56915 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSCP56915 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSCP56915 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSCP56915 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSCP56915 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSCP56915 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSCP56915 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSCP56915 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSCP56915 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSCP56915 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSCP56915 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSCP56915 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSCP56915 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSCP56915 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSCP56915 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSCP56915 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSCP56915 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSCP56915 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSCP56915 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSCP56915 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSCP56915 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSCP56915 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSCP56915 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSCP56915 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSCP56915 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSCP56915 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSCP56915 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSCP56915 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSCP56915 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSCP56915 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSCP56915 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GSCP56915 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSCP56915 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSCP56915 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSCP56915 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSCP56915 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSCP56915 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSCP56915 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms