Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBP2P56545 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms