Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms