Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.6
EPHB4P54760 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EPHB4P54760 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB4P54760 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms