Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA2D1P54289 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms