Protein–RNA interactions for Protein: P53804

TTC3, E3 ubiquitin-protein ligase TTC3, humanhuman

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3P53804 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC3P53804 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC3P53804 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC3P53804 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC3P53804 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC3P53804 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC3P53804 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC3P53804 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC3P53804 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC3P53804 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC3P53804 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC3P53804 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC3P53804 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC3P53804 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC3P53804 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC3P53804 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC3P53804 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC3P53804 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC3P53804 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC3P53804 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC3P53804 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC3P53804 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC3P53804 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC3P53804 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC3P53804 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC3P53804 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC3P53804 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC3P53804 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC3P53804 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC3P53804 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC3P53804 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC3P53804 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC3P53804 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC3P53804 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC3P53804 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC3P53804 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC3P53804 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC3P53804 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC3P53804 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC3P53804 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC3P53804 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC3P53804 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC3P53804 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC3P53804 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC3P53804 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC3P53804 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC3P53804 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC3P53804 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC3P53804 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC3P53804 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC3P53804 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC3P53804 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC3P53804 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC3P53804 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC3P53804 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC3P53804 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC3P53804 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC3P53804 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC3P53804 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC3P53804 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC3P53804 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC3P53804 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC3P53804 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC3P53804 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC3P53804 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC3P53804 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC3P53804 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC3P53804 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC3P53804 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC3P53804 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC3P53804 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC3P53804 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTC3P53804 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTC3P53804 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTC3P53804 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTC3P53804 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTC3P53804 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTC3P53804 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC3P53804 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC3P53804 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC3P53804 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC3P53804 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC3P53804 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC3P53804 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC3P53804 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC3P53804 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC3P53804 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC3P53804 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC3P53804 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC3P53804 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC3P53804 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC3P53804 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC3P53804 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC3P53804 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC3P53804 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC3P53804 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC3P53804 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC3P53804 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC3P53804 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC3P53804 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms