Protein–RNA interactions for Protein: P53127

SNT2, E3 ubiquitin-protein ligase SNT2, yeast

Predictions only

Length 1,403 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SNT2	P53127	YPL077C	YPL077C	723 nt		5.47	□□□□□ -1.53
SNT2	P53127	HRK1	YOR267C	2280 nt		5.47	□□□□□ -1.53
SNT2	P53127	IMP2	YMR035W	534 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	DBP10	YDL031W	2988 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	TAH18	YPR048W	1872 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	SPT10	YJL127C	1923 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	LCB5	YLR260W	2064 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	CHL4	YDR254W	1377 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	GAL4	YPL248C	2646 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	AIR1	YIL079C	1083 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	MNN11	YJL183W	1269 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	PDR12	YPL058C	4536 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	MSN2	YMR037C	2115 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	NPY1	YGL067W	1155 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	YHR212W-A	YHR212W-A	204 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	TMA19	YKL056C	504 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	YAR061W	YAR061W	204 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	FDH1	YOR388C	1131 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	HUT1	YPL244C	1020 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	NSI1	YDR026C	1713 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	ARN2	YHL047C	1863 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	OPT1	YJL212C	2400 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	SOH1	YGL127C	384 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	GTF1	YGR102C	552 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	RNR1	YER070W	2667 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	XKS1	YGR194C	1803 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	JIP4	YDR475C	2631 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	CDC45	YLR103C	1953 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	MSC7	YHR039C	1935 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	SRP72	YPL210C	1923 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	CDC11	YJR076C	1248 nt		5.41	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	CPR6	YLR216C	1116 nt		5.41	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	TIM12	YBR091C	330 nt		5.41	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	IDS2	YJL146W	1410 nt		5.41	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	PMT2	YAL023C	2280 nt		5.41	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	PRE9	YGR135W	777 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	RHO3	YIL118W	696 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	PWR1	PWR1	941 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SNT2	P53127	PTA1	YAL043C	2358 nt		5.4	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	MDL1	YLR188W	2088 nt		5.4	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	GUF1	YLR289W	1938 nt		5.4	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	YFR035C	YFR035C	345 nt		5.4	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	YGR051C	YGR051C	324 nt		5.4	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	PHA2	YNL316C	1005 nt		5.4	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	CAT5	YOR125C	702 nt		5.4	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	SRB6	YBR253W	366 nt		5.4	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	GDE1	YPL110C	3672 nt		5.4	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	RRN6	YBL014C	2685 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	DSF2	YBR007C	2211 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	YNL095C	YNL095C	1929 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	FLO5	YHR211W	3228 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	YER076C	YER076C	909 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	MAD2	YJL030W	591 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	PHO86	YJL117W	936 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	GCD14	YJL125C	1152 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	PLP2	YOR281C	861 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	SHQ1	YIL104C	1524 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	PMT6	YGR199W	2280 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	MCM7	YBR202W	2538 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	YPL041C	YPL041C	624 nt		5.38	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	YDR396W	YDR396W	501 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	AHP1	YLR109W	531 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	MOH1	YBL049W	417 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	OCA2	YNL056W	594 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	YKR023W	YKR023W	1593 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	AKR1	YDR264C	2295 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	HSP82	YPL240C	2130 nt		5.36	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	OPI6	YDL096C	327 nt		5.36	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	YMR122W-A	YMR122W-A	255 nt		5.36	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	RFC3	YNL290W	1023 nt		5.36	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	PIM1	YBL022C	3402 nt		5.36	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	MTD1	YKR080W	963 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	YOR073W-A	YOR073W-A	234 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	Q0010	Q0010	387 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	RKM2	YDR198C	1440 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	ALR2	YFL050C	2577 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	VHS3	YOR054C	2025 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	PTM1	YKL039W	1572 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	MSD1	YPL104W	1977 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	RRP17	YDR412W	708 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	CDC8	YJR057W	651 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	ADD66	YKL206C	804 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	IRC25	YLR021W	540 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	PRP19	YLL036C	1512 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	NUG1	YER006W	1563 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SNT2	P53127	MAP1	YLR244C	1164 nt		5.33	□□□□□ -1.56
SNT2	P53127	snR32	snR32	188 nt		5.33	□□□□□ -1.56
SNT2	P53127	RPN2	YIL075C	2838 nt		5.33	□□□□□ -1.56
SNT2	P53127	YCF1	YDR135C	4548 nt		5.33	□□□□□ -1.56
SNT2	P53127	ZRC1	YMR243C	1329 nt		5.33	□□□□□ -1.56
SNT2	P53127	VPS73	YGL104C	1461 nt		5.33	□□□□□ -1.56
SNT2	P53127	BUD14	YAR014C	2130 nt		5.33	□□□□□ -1.56
SNT2	P53127	RPB3	YIL021W	957 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SNT2	P53127	HOS2	YGL194C	1359 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SNT2	P53127	ECM4	YKR076W	1113 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SNT2	P53127	YAL064W-B	YAL064W-B	381 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SNT2	P53127	RPS1B	YML063W	768 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SNT2	P53127	FSH3	YOR280C	801 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SNT2	P53127	FDH2	YPL275W	711 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SNT2	P53127	RAD53	YPL153C	2466 nt		5.31	□□□□□ -1.56

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.7 ms