Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA4P52798 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA4P52798 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms