Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERFP50548 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERFP50548 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERFP50548 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERFP50548 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERFP50548 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERFP50548 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERFP50548 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ERFP50548 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
ERFP50548 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERFP50548 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERFP50548 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERFP50548 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERFP50548 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERFP50548 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERFP50548 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERFP50548 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERFP50548 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERFP50548 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERFP50548 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERFP50548 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERFP50548 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERFP50548 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERFP50548 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERFP50548 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERFP50548 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERFP50548 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERFP50548 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERFP50548 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERFP50548 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERFP50548 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERFP50548 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERFP50548 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERFP50548 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERFP50548 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERFP50548 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERFP50548 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERFP50548 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERFP50548 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERFP50548 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERFP50548 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERFP50548 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERFP50548 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERFP50548 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERFP50548 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERFP50548 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERFP50548 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERFP50548 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERFP50548 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERFP50548 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERFP50548 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERFP50548 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERFP50548 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERFP50548 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERFP50548 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERFP50548 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERFP50548 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERFP50548 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERFP50548 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERFP50548 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERFP50548 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERFP50548 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERFP50548 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERFP50548 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERFP50548 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERFP50548 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERFP50548 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERFP50548 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERFP50548 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERFP50548 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERFP50548 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERFP50548 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERFP50548 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERFP50548 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERFP50548 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERFP50548 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERFP50548 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERFP50548 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERFP50548 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERFP50548 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERFP50548 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERFP50548 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERFP50548 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERFP50548 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERFP50548 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERFP50548 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERFP50548 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERFP50548 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERFP50548 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERFP50548 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERFP50548 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERFP50548 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERFP50548 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERFP50548 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERFP50548 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ERFP50548 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERFP50548 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERFP50548 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERFP50548 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ERFP50548 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms