Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IDH3AP50213 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms