Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUFMP49411 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUFMP49411 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUFMP49411 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUFMP49411 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUFMP49411 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUFMP49411 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUFMP49411 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUFMP49411 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUFMP49411 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUFMP49411 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUFMP49411 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUFMP49411 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUFMP49411 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUFMP49411 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TUFMP49411 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUFMP49411 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUFMP49411 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUFMP49411 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUFMP49411 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUFMP49411 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUFMP49411 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUFMP49411 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUFMP49411 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUFMP49411 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUFMP49411 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TUFMP49411 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUFMP49411 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUFMP49411 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUFMP49411 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUFMP49411 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUFMP49411 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFMP49411 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFMP49411 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFMP49411 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFMP49411 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFMP49411 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFMP49411 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFMP49411 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFMP49411 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFMP49411 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFMP49411 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUFMP49411 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFMP49411 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFMP49411 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFMP49411 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFMP49411 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFMP49411 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFMP49411 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFMP49411 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUFMP49411 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUFMP49411 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUFMP49411 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUFMP49411 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUFMP49411 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TUFMP49411 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUFMP49411 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUFMP49411 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TUFMP49411 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUFMP49411 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUFMP49411 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUFMP49411 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUFMP49411 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUFMP49411 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUFMP49411 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUFMP49411 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUFMP49411 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUFMP49411 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUFMP49411 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUFMP49411 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUFMP49411 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUFMP49411 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUFMP49411 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUFMP49411 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUFMP49411 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUFMP49411 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUFMP49411 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUFMP49411 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUFMP49411 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUFMP49411 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUFMP49411 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TUFMP49411 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUFMP49411 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUFMP49411 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUFMP49411 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUFMP49411 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUFMP49411 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUFMP49411 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUFMP49411 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUFMP49411 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUFMP49411 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUFMP49411 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUFMP49411 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TUFMP49411 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUFMP49411 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUFMP49411 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUFMP49411 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUFMP49411 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUFMP49411 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUFMP49411 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms