Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK8P49336 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK8P49336 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK8P49336 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK8P49336 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK8P49336 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK8P49336 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK8P49336 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK8P49336 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK8P49336 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK8P49336 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK8P49336 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK8P49336 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK8P49336 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK8P49336 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK8P49336 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK8P49336 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK8P49336 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK8P49336 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK8P49336 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK8P49336 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK8P49336 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK8P49336 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK8P49336 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK8P49336 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK8P49336 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK8P49336 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK8P49336 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK8P49336 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK8P49336 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK8P49336 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK8P49336 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK8P49336 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK8P49336 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK8P49336 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK8P49336 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK8P49336 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK8P49336 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK8P49336 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK8P49336 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK8P49336 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK8P49336 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK8P49336 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK8P49336 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK8P49336 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK8P49336 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK8P49336 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK8P49336 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK8P49336 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK8P49336 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK8P49336 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK8P49336 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK8P49336 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK8P49336 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK8P49336 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK8P49336 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK8P49336 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK8P49336 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK8P49336 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK8P49336 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK8P49336 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK8P49336 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK8P49336 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK8P49336 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK8P49336 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK8P49336 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK8P49336 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK8P49336 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK8P49336 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK8P49336 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK8P49336 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK8P49336 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK8P49336 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK8P49336 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK8P49336 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK8P49336 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK8P49336 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK8P49336 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK8P49336 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK8P49336 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK8P49336 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK8P49336 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK8P49336 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK8P49336 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK8P49336 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK8P49336 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK8P49336 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK8P49336 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK8P49336 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK8P49336 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK8P49336 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK8P49336 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK8P49336 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK8P49336 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDK8P49336 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK8P49336 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK8P49336 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK8P49336 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK8P49336 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDK8P49336 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms