Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC11A1P49279 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms