Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC1A6P48664 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms