Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NRIP1P48552 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NRIP1P48552 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRIP1P48552 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms