Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEDD4P46934 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD4P46934 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms