Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CRATP43155 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRATP43155 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CRATP43155 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CRATP43155 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRATP43155 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRATP43155 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRATP43155 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRATP43155 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CRATP43155 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRATP43155 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRATP43155 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRATP43155 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRATP43155 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRATP43155 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRATP43155 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRATP43155 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRATP43155 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRATP43155 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRATP43155 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRATP43155 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRATP43155 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRATP43155 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRATP43155 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRATP43155 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRATP43155 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRATP43155 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRATP43155 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRATP43155 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRATP43155 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRATP43155 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRATP43155 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRATP43155 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRATP43155 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRATP43155 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRATP43155 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRATP43155 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRATP43155 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRATP43155 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRATP43155 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRATP43155 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRATP43155 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRATP43155 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRATP43155 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRATP43155 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRATP43155 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRATP43155 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRATP43155 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CRATP43155 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRATP43155 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRATP43155 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRATP43155 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRATP43155 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CRATP43155 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRATP43155 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRATP43155 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRATP43155 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CRATP43155 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRATP43155 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRATP43155 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRATP43155 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRATP43155 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRATP43155 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRATP43155 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRATP43155 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRATP43155 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRATP43155 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRATP43155 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRATP43155 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRATP43155 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRATP43155 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRATP43155 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRATP43155 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRATP43155 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CRATP43155 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRATP43155 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CRATP43155 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRATP43155 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRATP43155 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRATP43155 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRATP43155 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CRATP43155 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRATP43155 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRATP43155 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRATP43155 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRATP43155 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRATP43155 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRATP43155 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRATP43155 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRATP43155 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRATP43155 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRATP43155 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CRATP43155 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRATP43155 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRATP43155 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRATP43155 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRATP43155 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRATP43155 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRATP43155 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRATP43155 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms