Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ACAA2P42765 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms