Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP2P42575 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP2P42575 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP2P42575 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP2P42575 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP2P42575 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP2P42575 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP2P42575 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP2P42575 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP2P42575 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP2P42575 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASP2P42575 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASP2P42575 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASP2P42575 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP2P42575 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP2P42575 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP2P42575 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP2P42575 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP2P42575 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP2P42575 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP2P42575 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP2P42575 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP2P42575 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP2P42575 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP2P42575 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP2P42575 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP2P42575 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP2P42575 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP2P42575 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP2P42575 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP2P42575 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP2P42575 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP2P42575 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP2P42575 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP2P42575 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP2P42575 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP2P42575 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP2P42575 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP2P42575 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP2P42575 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP2P42575 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP2P42575 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP2P42575 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP2P42575 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP2P42575 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP2P42575 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP2P42575 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP2P42575 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP2P42575 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP2P42575 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP2P42575 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP2P42575 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP2P42575 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP2P42575 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP2P42575 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP2P42575 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP2P42575 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP2P42575 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP2P42575 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP2P42575 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP2P42575 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP2P42575 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP2P42575 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP2P42575 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP2P42575 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP2P42575 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP2P42575 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP2P42575 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP2P42575 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP2P42575 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP2P42575 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP2P42575 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP2P42575 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP2P42575 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP2P42575 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP2P42575 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP2P42575 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP2P42575 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP2P42575 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP2P42575 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP2P42575 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP2P42575 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP2P42575 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP2P42575 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP2P42575 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP2P42575 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP2P42575 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP2P42575 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP2P42575 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP2P42575 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP2P42575 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP2P42575 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP2P42575 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP2P42575 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP2P42575 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP2P42575 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP2P42575 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP2P42575 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP2P42575 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP2P42575 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms