Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC26A3P40879 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms