Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH1P40692 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH1P40692 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH1P40692 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH1P40692 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLH1P40692 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MLH1P40692 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MLH1P40692 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MLH1P40692 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MLH1P40692 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MLH1P40692 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MLH1P40692 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MLH1P40692 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MLH1P40692 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MLH1P40692 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MLH1P40692 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MLH1P40692 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH1P40692 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH1P40692 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH1P40692 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH1P40692 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH1P40692 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH1P40692 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH1P40692 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH1P40692 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH1P40692 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH1P40692 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH1P40692 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH1P40692 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH1P40692 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH1P40692 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH1P40692 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH1P40692 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLH1P40692 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH1P40692 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH1P40692 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH1P40692 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH1P40692 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH1P40692 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH1P40692 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH1P40692 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH1P40692 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH1P40692 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH1P40692 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH1P40692 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH1P40692 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLH1P40692 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
MLH1P40692 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MLH1P40692 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MLH1P40692 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MLH1P40692 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MLH1P40692 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MLH1P40692 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MLH1P40692 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MLH1P40692 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MLH1P40692 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MLH1P40692 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MLH1P40692 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MLH1P40692 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MLH1P40692 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH1P40692 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH1P40692 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH1P40692 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH1P40692 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH1P40692 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH1P40692 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH1P40692 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH1P40692 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MLH1P40692 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH1P40692 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH1P40692 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH1P40692 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH1P40692 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH1P40692 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH1P40692 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH1P40692 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH1P40692 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH1P40692 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH1P40692 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MLH1P40692 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MLH1P40692 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MLH1P40692 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MLH1P40692 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MLH1P40692 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MLH1P40692 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MLH1P40692 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MLH1P40692 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MLH1P40692 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH1P40692 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH1P40692 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH1P40692 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH1P40692 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH1P40692 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH1P40692 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH1P40692 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH1P40692 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH1P40692 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH1P40692 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH1P40692 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MLH1P40692 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms