Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL13AP40429 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms