Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBX1P40424 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBX1P40424 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBX1P40424 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBX1P40424 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBX1P40424 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PBX1P40424 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBX1P40424 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBX1P40424 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBX1P40424 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBX1P40424 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PBX1P40424 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PBX1P40424 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBX1P40424 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBX1P40424 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBX1P40424 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PBX1P40424 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBX1P40424 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBX1P40424 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBX1P40424 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBX1P40424 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBX1P40424 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBX1P40424 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBX1P40424 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PBX1P40424 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBX1P40424 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBX1P40424 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBX1P40424 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBX1P40424 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX1P40424 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX1P40424 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX1P40424 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX1P40424 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX1P40424 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX1P40424 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX1P40424 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX1P40424 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX1P40424 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX1P40424 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX1P40424 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX1P40424 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX1P40424 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX1P40424 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX1P40424 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX1P40424 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX1P40424 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX1P40424 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX1P40424 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX1P40424 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX1P40424 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX1P40424 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX1P40424 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBX1P40424 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBX1P40424 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBX1P40424 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBX1P40424 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PBX1P40424 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBX1P40424 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBX1P40424 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PBX1P40424 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX1P40424 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX1P40424 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX1P40424 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX1P40424 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX1P40424 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX1P40424 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX1P40424 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX1P40424 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX1P40424 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX1P40424 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX1P40424 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX1P40424 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX1P40424 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX1P40424 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX1P40424 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX1P40424 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX1P40424 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX1P40424 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX1P40424 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX1P40424 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX1P40424 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX1P40424 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX1P40424 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX1P40424 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX1P40424 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX1P40424 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX1P40424 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX1P40424 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX1P40424 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX1P40424 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX1P40424 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX1P40424 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX1P40424 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX1P40424 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX1P40424 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBX1P40424 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBX1P40424 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBX1P40424 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBX1P40424 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBX1P40424 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms