Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM23P36406 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms