Protein–RNA interactions for Protein: P35914

HMGCL, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCLP35914 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGCLP35914 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGCLP35914 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGCLP35914 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGCLP35914 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGCLP35914 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGCLP35914 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGCLP35914 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGCLP35914 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGCLP35914 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGCLP35914 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGCLP35914 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGCLP35914 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGCLP35914 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGCLP35914 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGCLP35914 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGCLP35914 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGCLP35914 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGCLP35914 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGCLP35914 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGCLP35914 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGCLP35914 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGCLP35914 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGCLP35914 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGCLP35914 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGCLP35914 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HMGCLP35914 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms