Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COPB2P35606 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COPB2P35606 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COPB2P35606 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COPB2P35606 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COPB2P35606 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COPB2P35606 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COPB2P35606 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COPB2P35606 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
COPB2P35606 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COPB2P35606 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COPB2P35606 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COPB2P35606 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COPB2P35606 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COPB2P35606 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COPB2P35606 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COPB2P35606 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COPB2P35606 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
COPB2P35606 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COPB2P35606 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
COPB2P35606 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COPB2P35606 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPB2P35606 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPB2P35606 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPB2P35606 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPB2P35606 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPB2P35606 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPB2P35606 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPB2P35606 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPB2P35606 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPB2P35606 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPB2P35606 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPB2P35606 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPB2P35606 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPB2P35606 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPB2P35606 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPB2P35606 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPB2P35606 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPB2P35606 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPB2P35606 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COPB2P35606 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COPB2P35606 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COPB2P35606 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COPB2P35606 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COPB2P35606 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
COPB2P35606 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COPB2P35606 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COPB2P35606 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COPB2P35606 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COPB2P35606 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COPB2P35606 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COPB2P35606 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COPB2P35606 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COPB2P35606 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COPB2P35606 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COPB2P35606 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COPB2P35606 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COPB2P35606 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COPB2P35606 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COPB2P35606 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COPB2P35606 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COPB2P35606 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COPB2P35606 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COPB2P35606 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPB2P35606 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPB2P35606 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPB2P35606 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPB2P35606 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPB2P35606 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPB2P35606 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPB2P35606 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
COPB2P35606 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPB2P35606 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPB2P35606 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
COPB2P35606 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
COPB2P35606 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COPB2P35606 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COPB2P35606 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COPB2P35606 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COPB2P35606 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COPB2P35606 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
COPB2P35606 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COPB2P35606 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
COPB2P35606 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COPB2P35606 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COPB2P35606 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPB2P35606 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPB2P35606 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPB2P35606 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPB2P35606 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPB2P35606 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPB2P35606 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
COPB2P35606 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPB2P35606 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
COPB2P35606 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
COPB2P35606 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
COPB2P35606 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
COPB2P35606 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
COPB2P35606 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
COPB2P35606 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms