Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms