Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA3P32297 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms