Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASQ1P31415 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
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